間充質干細胞具有許多令人著迷的特性，包括強大的免疫調節作用、修復受損組織的能力以及體外分化為其他細胞類型的能力。這些特性，加上它們易于從不同來源獲得，促使研究人員將間充質干細胞視為有前景的原材料，用于細胞治療、基因治療和組織工程（再生醫學的三大支柱）。科學家、研究人員和生命科學公司的累積努力已開發出10種基于MSC的經批準的療法和19種基于MSC的經批準的骨基質。

隨著間充質干細胞融入再生醫學技術，預計將迎來一個激動人心的新時代。特別是，新興技術（例如間充質干細胞的生物工程以執行特定功能）具有臨床轉化的潛力，使用間充質干細胞衍生的外泌體代替整個間充質干細胞，并通過在體內大量利用它們來擴大間充質干細胞的用途。新興產業，例如清潔肉類產業。

Alexander Friedenstein首次將MSC鑒定為集落形成單位成纖維細胞 (CFU-F) 和成骨干細胞。從那時起，人們創造了許多名稱來表示間充質干細胞 (MSC)，其中包括 Maureen Owen 博士于1988年提出的“基質干細胞”。

1991年，阿諾德·卡普蘭博士。創造了“間充質干細胞”一詞，以強調細胞的自我更新特性和分化潛力。

后來，這個名字受到詹姆斯·丹尼斯博士的挑戰。和同事認為這些細胞的行為類似于祖細胞而不是干細胞。他們提出了“間充質祖細胞”這一術語。

2000年，Paolo Bianco醫學博士和 Pamela Gehron Robey 博士 提出“骨骼干細胞”這個名稱是為了強調細胞產生骨骼系統組成部分的事實。

后來，“多能成體祖細胞”這個術語是由姜躍華博士及其同事創造的。

2010年，阿諾德·卡普蘭博士。修改了他之前的立場，并建議縮寫MSC代表“醫學信號細胞”。隨著時間的推移，科學界已經達成了相對統一的共識，即“MSC”一詞是命名這些細胞的可接受的方式。這個縮寫詞滿足了反對使用“干細胞”一詞來識別 MSC 的強大而直言不諱的社區的需求，因為它們的行為并非如此。

間充質干細胞可以從多種組織中分離出來。最初，弗里登斯坦等人。從骨髓（BM）以及脾和胸腺的基質中分離出MSC。此后，間充質干細胞源自腦、脾、肝、腎、肺、骨髓、肌肉、胸腺和胰腺等多種組織。然而，骨髓抽吸物仍然被認為是最方便、最豐富的間充質干細胞來源。

胎兒組織也含有間充質干細胞，常見來源包括臍帶血和胎兒胎盤。這些來源可能代表個體發育上較年輕的 MSC。有證據表明，與來自成人組織的MSC相比，來自胎兒的MSC在衰老之前可以經歷更多的細胞分裂。不同來源的間充質干細胞在遺傳水平上的變異也已得到充分記錄，細胞產生的趨化因子和細胞因子的類型也存在差異。

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